در مدرسه زندگی مهرستان، خانواده در تربیت و لزوم تعامل و همکاری بین خانواده و مدرسه تاکید دارد و در نظام تربیت محور آن، خانواده محوری نقشی پررنگ و به سزا دارد. خانواده به عنوان رکن اصلی تربیت در پیشبرد اهداف مدرسه زندگی نقشی جدی و بی بدیل ایفا می کند. از سوی دیگر با توجه به آمادگی رهپویان برای خانواده و مدرسه زندگی میتواند زمینه بهتری برای کسب این شایستگی در رهپویان ایجاد کند.

این مولفه با تاکید بر برابری جایگاه انسانی دختر و پسر ، به تفاوت برخی از ویژگی های تکوینی و نقش‌های خانوادگی توجه دارد. در مدرسه زندگی مهرستان باتوجه به تربیت محور بودن آن؛ هویت دخترانه به این معناست که خداوند متعال موهبت دختر بودن را به دختران ارزانی داشته است. در مدرسه زندگی مهرستان این تمایزها در هدف گذاری، محتوا، روش تربیت، ساختار مدرسه و حتی معماری مدرسه مورد توجه است.